মুক্তিযুদ্ধের সময় রংপুর অঞ্চলে মানবতাবিরোধী অপরাধের দায়ে ২০১৪ সালের ৩০ ডিসেম্বর আজহারকে মৃত্যুদণ্ড দেন আন্তর্জাতিক অপরাধ ট্রাইব্যুনাল। এ রায়ের বিরুদ্ধে আপিল করেন জামায়াতের এই নেতা।
২০১৯ সালের ২৩ অক্টোবর এটিএম আজহারুল ইসলামের মৃত্যুদণ্ডের রায় বহাল রাখেন আপিল বিভাগ। পরে এ রায় পুনর্বিবেচনা চেয়ে আবেদন করেন আজহার। আওয়ামী লীগের সময়ে দেয়া রায়কে প্রহসন বলে দাবি করে আসছে তার আইনজীবী ও জামায়াতে ইসলামী।
জামায়াতের সহকারী সেক্রেটারি জেনারেল এটিএম আজহারুল ইসলামের মুক্তির দাবিতে সম্প্রতি বিক্ষোভ সমাবেশ করে দলটি। তার মুক্তির দাবিতে প্রধান উপদেষ্টার কার্যালয়ের সামনে গণঅবস্থান এবং জামায়াতের আমীর স্বেচ্ছায় গ্রেপ্তারের কর্মসূচি দিলেও দেশের সামগ্রিক পরিস্থিতি বিবেচনায় তা স্থগিত করে দলটি।
