২০০৭ সালের সেনা সমর্থিত তত্ত্বাবধায়ক সরকারের আমলে লুৎফুজ্জামান বাবরের বাসা থেকে লাইসেন্স বিহীন রিভলভার পাওয়ার দাবি করা হয়। গ্রেপ্তারের সাতদিন পর গুলশান থানায় অস্ত্র মামলা দায়ের করে পুলিশ।
এ মামলায় ২০০৭ সালের ৩০ অক্টোবর বাবরকে ১৭ বছরের কারাদণ্ড দেন ঢাকার একটি বিশেষ আদালত।
বাবরের পক্ষে আইনজীবী বলেন, ‘যৌথবাহিনী গ্রেপ্তারের ৭ দিন পর উদ্দেশ্যমূলকভাবে এই মামলা দায়ের করা হয়। এজাহারে বলা হয় একটি লাল-কালো ব্যাগ থেকে অস্ত্র উদ্ধার করা হয় কিন্তু শব্দ তালিকায় সেই ব্যাগ ছিল না।’