হবিগঞ্জ-৪ আসনের সাবেক এই সংসদ সদস্য রাজধানীর নিউমার্কেট এলাকায় হত্যা ও ভাংচুরের অভিযোগে তিনটি মামলায় এখন ঢাকা কেন্দ্রীয় কারাগারে আছেন। গত ১৫ সেপ্টেম্বর রাতে রাজধানীর সেগুনবাগিচা এলাকা থেকে তাকে গ্রেপ্তার করা হয়। পরে বৈষম্যবিরোধী ছাত্র আন্দোলন চলাকালে হবিগঞ্জের মাধবপুরে জগদীশপুর মুক্তিযোদ্ধা চত্ত্বর, পৌরসভা ও ডাকবাংলোয় হামলার অভিযোগে ১৯ সেপ্টেম্বর মামলা দায়ের করা মামলায় তাকে শ্যোন এরেস্ট দেখানো হয়।
হবিগঞ্জ জেলা ও দায়রা জজ আদালতের বেঞ্চ সহকারি ফাহিমা আক্তার খান জানান, মাধবপুরের মামলায় মাহবুব আলীকে হামলার নির্দেশদাতা হিসেবে অভিযুক্ত করা হয়। পরে মামলার তদন্তকারী কর্মকর্তার আবেদনের পরিপ্রেক্ষিতে হবিগঞ্জের সিনিয়র জুডিসিয়াল ম্যাজিস্ট্রেট মোহাম্মদ হারুন-অর-রশীদ মাহবুব আলীকে শ্যোন এরেস্টের আদেশ দেন।
মঙ্গলবার মাহবুব আলীর ছোট ভাই আইনজীবী ফজলে আলী হবিগঞ্জের জেলা ও দায়রা জজ আদালতে তার জামিন আবেদন করেন। শুনানি শেষে বিচারক সাবেক প্রতিমন্ত্রী মাহবুব আলীর জামিন মঞ্জুর করেন।